De acuerdo con la Estrategia de Políticas de Formación Sistema Sanitario Público de Andalucía, en su Línea Estratégica nº 5: «Avanzar en la ordenación del sistema de Formación Sanitaria Especializada y potenciar las políticas de alianzas para grado, posgrado, formación profesional y formación en salud para la ciudadanía en el SSPA», en el Objetivo Estratégico 5.2.: «Avanzar en las políticas de alianzas del SSPA para Grado, Posgrado y Formación Profesional», la Unidad trata de consolidar las alianzas con las Universidades Andaluzas para la mejora del modelo de calidad de la formación práctico-clínica del grado y posgrado en ciencias de la salud y en la incorporación de las no sanitarias.
La formación práctico-clínica de los futuros profesionales sanitarios y lo referente a la investigación y docencia está regulada por el Real Decreto 1558/86 de 28 de junio que desarrolla las bases de conciertos entre la Universidad y las Instituciones sanitarias y por el CONVENIO-MARCO, suscrito en 1995 entre Consejería de Salud, Consejería de Educación y Universidades Andaluzas y por la ADENDA de 7 de julio de 2008.
