La Sección de Investigación se encuentra ubicada estructuralmente dentro de la Unidad de Gestión del Conocimiento, en la planta semisótano del Hospital Universitario Torrecárdenas.
En dicha localización se encuentran ubicados los despachos de trabajo del Gestor de Convocatorias y de la Metodólogo-Estadística, ambos de la fundación FIBAO.
Asimismo, se encuentra el despacho de Coordinación de la Sección.
En la última planta del centro hospitalario pero vinculado a la Sección de Investigación se ubica la Biblioteca y la especialista en Documentación. También en esta última planta se encuentra la secretaria de la Sección de Investigación.
